启东位于长江入海口北侧，长江、东海、黄海在此交汇。南与上海隔江相邻，直线距离仅为50公里；东与日本、韩国隔海相望，距离400海里。境内吕四港正在申报国家一类开放口岸，是我国长三角地区不可多得的10万吨级深水大港。
公路：
崇启大桥（G40沪陕高速）及宁启、扬启高速公路穿境而过，到上海外高桥港区仅需35分钟车程，到上海市中心仅需1小时车程。启东境内交通便捷，已形成“六纵六横两沿一环”公路网，“六纵”即天汾至启隆公路、吕北公路、志圩公路、335省道、海惠公路和东和公路；“六横”即王海公路、南海公路、通海公路、北环公路、336省道和启隆乡—崇明界公路；“两沿”为苏221线沿海公路和沿江高等级公路；一环是启东城区绕城公路。
铁路：
宁启铁路、宁启铁路北沿线已经动工。
水路：
建设中的中国吕四港为10万吨级的深水大港，可建万吨级泊位40多个；境内内河发达，通江达海，水运便捷，主要有通吕运河，大洋港河，新三港河，茅家港河，新港河，蒿枝港河，头兴港河等。
航运：
上海浦东机场（45分钟），上海虹桥机场（90分钟），南通兴东机场（60分钟）。
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